微陣列芯片應用流程
1)制備靶點
從生物標本中提取核苷酸并進行標記;
(2)雜交
讓靶點與芯片上的cDNA或寡核苷酸序列進行孵育;
(3)獲取數(shù)據(jù)
掃描與探針雜交的靶點表現(xiàn)出來的信號強度
(4)數(shù)據(jù)分析
從大量數(shù)據(jù)中得出具有生物學意義的結論
微陣列芯片技術通過測定能夠與探針雜交的mRNA的數(shù)量,反映表達此mRNA的***的轉錄情況,微陣列基片的價格,芯片的構建首先要根據(jù)研究的需要選擇***及相應的探針,其次是從標本中提取mRNA,并制備出靶點,然后將靶點加入芯片,進行孵育雜交、沖洗掉沒有雜交的樣品以及掃描等操作,廣東微陣列基片,得到原始數(shù)據(jù),再將這些數(shù)據(jù)進行標準化和統(tǒng)計分析后得到結論,構造適當?shù)奈㈥嚵行酒情_展后續(xù)研究的基礎。
2.APES(3-氨丙基-乙氧基)
APES必須現(xiàn)用現(xiàn)配。用此方法黏合的玻片應垂直烤片而不能水平烤片,微陣列基片廠家,否則,***片中易出現(xiàn)氣泡。 APES的使用方法:用50倍稀釋(APESl份、49份混合),將洗凈的玻片放人稀釋好的APES中,停留20~30秒,取出稍停,再人純或蒸餾水中涮去未結合的APES。置通風櫥中晾干即可。注意用APES防脫片處理的載玻片撈片時***應一步到位.并盡量減少氣泡存在,以免影響染色結果。注意不要將APES與其他防脫混合使用。
使用廣泛的氨基和羧基偶聯(lián)劑就要數(shù)EDC和NHS(Sulfo-NHS)了。大多數(shù)情況下,微陣列基片是什么,同時使用EDC/NHS的交聯(lián)于只使用EDC的,NHS的使用能夠極大增強偶聯(lián)效率。但也有個例,比如2012年的一篇工作(Diagnostics (Basel). 2012 Aug 27;2(3):23-33.),他們在APETS修飾的金芯片和96孔板表面組裝一抗,發(fā)現(xiàn)單獨使用EDC比同時使用EDC/NHS和EDC/Sulfo-NHS都。
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