分子實驗介紹——印跡(Western blot)檢測
通過SDS-PAGE凝膠將細胞或生物樣品內(nèi)的蛋白按照蛋白分子量從大到小規(guī)律分離開。經(jīng)過PAGE分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體(例如纖維素薄膜或PVDF膜)上,pcr引物設計,固相載體以非共價鍵形式吸附蛋白質(zhì),且能保持電泳分離的多肽類型及其生物學活性不變。以固相載體上的蛋白質(zhì)或多肽作為抗原,與對應的起反應,再與酶或同位素標記的第二起反應(目前主要用HRP標記的第二),經(jīng)過底物顯色或自顯影以檢測電泳分離的特異性目的***表達的蛋白成分(目前主要使用魯米諾和二抗中的HRP反應發(fā)出熒光,通過儀器或者膠片顯色)。該技術廣泛應用于檢測蛋白水平的表達。
實驗流程:細胞收集-細胞裂解,蛋白提取-蛋白變性-SDS-PAGE電泳-蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)膜印記-蛋白封閉-目的孵育-二抗孵育-顯色拍照
結(jié)果示例:
圖 A不同大小的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細胞后,Western blot檢測圖片;B A蛋白不同培養(yǎng)時間后Western blot檢測圖片;C 使用Image pro plus軟件對A蛋白灰度檢測,A蛋白表達變化統(tǒng)計圖
RNA提取處理的步驟如下:
在玻璃燒杯中注入去離子水,加入DEPC使其終濃度為0.05%~0.1%(DEPC-H2O)。(DEPC二焦碳酸酯為活性很強的物,須在通風櫥中小心使用)
將待處理的塑料制品放入一個可以高溫滅菌的容器中,注入DEPC-H2O,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中,pcr,在通風柜中37℃ 或室溫下處理過夜。
將DEPC-H2O小心倒入廢液瓶中,將裝有DEPC- H2O 處理過的塑料制品的容器以鋁箔封口,高溫高壓蒸汽滅菌至少30分鐘。
滅菌塑料制品烘烤干燥,置潔凈處備用。
玻璃和金屬物品250 ℃烘烤3小時以上。
RNA pull down 檢測
RNA pull down:RNA沉淀檢測,dna檢測,是檢測RNA結(jié)合蛋白與其靶RNA之間相互作用的主要實驗方法之一。使用體外轉(zhuǎn)錄將RNA進行生物素標記,***檢測多少錢,并與細胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白復合物。復合物通過磁珠結(jié)合后分離,復合物純化洗脫后通過Western blot驗證檢測特性的蛋白。若篩選可能結(jié)合的蛋白通過質(zhì)譜實驗進行檢測篩選。
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