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18.引物是經過PAGE純化的,為什么還有堿基缺失或插入?
答:理論上分析型PAGE變性電泳,可以區(qū)分引物之間一個堿基的差別。但是制備PAGE電泳,上樣量都是非常大,電泳時的條帶非常寬,帶與帶之間有重疊,分辨率已下降,pcr實驗室,電泳后割帶回收目的引物時,很難說不割到差別僅幾個堿基的引物。國內有一個不好的現象,PAGE純化的引物,特別是長引物要的量都比較高,導致割的條帶有時可能比較寬。建議:您如果減少OD數,引物遇到的問題可能就會少一些。
19. TaqMan 探針設計的基本原則是什么?
答:下列原則供您參考。
◆TaqMan 探針位置盡可能靠近擴增引物(擴增產物50-150bp),但不能與引物重疊。
◆長度一般為18-40mer 。
◆G-C含量控制在40-80%左右。
◆避免連續(xù)相同堿基的出現,PCR,特別是要避免GGGG或更多G出現。
◆在引物的5"端避免使用G。
◆選用比較多的堿基C。
◆退火溫度Tm控制在 68-70C 左右。
有用的熒光染料參數
線粒體測序
線粒體是真核生物的重要細胞器,是生物體的能量工廠,參與能量代謝、信號轉導、細胞凋亡等許多生命活動,對生物的生理活動起著至關重要的作用。大部分線粒體***由于其母系遺傳特性以及進化速率較快等特點,被廣泛地用于種群遺傳學、進化生物學、譜系地理學和系統發(fā)育學、***診斷等學科領域。線粒體全***組在生物進化的研究中具有的優(yōu)勢。由于線粒體有著與真核生物長期共生的進化歷史,因此其***組包含了反映物種進化的關鍵信息,同時,相對于核***組,線粒體***組小,容易對大量物種進行橫向的比較分析,有利于生物進化的研究,因而受到進化生物學家的鐘愛。線粒體的組成可以從兩個層面上反映物種及群體的遺傳和進化,即核酸序列組成和***組的結構特征,兩者的特征具有不同的進化機制和進化速度,在進化生物學研究中可以很好的互補。
聚合酶鏈式反應(PCR)
操作步驟
1.在冰浴中,臺州pcr,按以下次序將各成分加入一無菌0.5ml離心管中。
1QPCR buffer
5 μl
dNTP mix( 2mM )
4 μl
引物1(10pM)
μl 2
引物2 ( 10pM)
2μl
Taq酶(2U/ul)
1 μl
DNA模板( 50ng-1μg/μl )
1 μl
加ddH2O至
μl 50
視PCR儀有無熱蓋,不加或添加石蠟油。
2.調整好反應程序。將上述混合液稍加離心,立即置PCR儀上執(zhí)行擴增。-般:在93°C
預變性3-5min ,進入循環(huán)擴增階段: 93°C 40s→58°C 30s→72°C 60s ,循環(huán)30-35
次,后在72°C保溫7min。
3.結束反應,***檢測多少錢, PCR產物放置于4°C待電泳檢測或-20°C長期保存。
4. PCR的電泳檢測:如在反應管中加有石蠟油,需用100ul進行抽提反應混合液,以
除去石蠟油;否則,直接取5- 10μl電泳檢測。
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